სსმმს-ს საქმიანობის ძირითად მიმართულებებს წარმოადგენს:
ეთნიკურ, რელიგიურ და ლინგვისტურ უმცირესობათა პოტენციალის აქტივაცია, უფლებების დაცვა და განვითარება, ასევე მათი აქტიური მოქალაქეობრივი მონაწილეობა ყველა დონეზე.
კონფლიქტების გადაჭრა და პრევენცია, მშვიდობის აღმშენებლობა და სამოქალაქო თანხმობა.
დემოკრატიულ ტრანსფორმაციისა და საქართველოს ევროპული ინტეგრაციისათვის ხელშეწყობა.დეცენტრალიზაციის პროცესებისა და ადგილობრივი თვითმმართველობის დამკვიდრებისათვის ხელშეწყობა, ასევე ადგილობრივი სათვისტომოების განვითარება.
კულტურათშორისი დიალოგისა და გაცვლის განვითარება, ასევე საზოგადოებაში ეთნოსთაშორისი ურთიერთობების ჰარმონიზაცია